最终导致基因改造人的独裁政权被推翻。
而可汗等八十个基因改造人逃过了制裁，自我流放到了外太空。
当时新政府由于害怕可汗消失的消息引起恐慌，就对公众隐瞒了这个事实。
此后基因改造技术被禁止。
马库斯上将发现一切后。
决定唤醒了可汗，利用这个全面超越人类的基因改造人，推进他的联邦星际舰队军事化大业。
在亚历山大·马库斯看来，现今的联邦人民实在是太安逸了，无法扛起战争。
要对付野蛮的克林贡帝国。
亚历山大·马库斯需要一个同样野蛮的、残忍的、野性的、战士的头脑来辅助，而基因改造人可汗·努尼恩·辛格则满足所有的要求，这些高智商的强横基因改造人就是为战争而生的，他们的体魄、他们的思维、他们的一切皆是为了战争服务。
利用活着的七十二个基因改造人，这些可汗·努尼恩·辛格仅存的族人，亚历山大·马库斯与可汗达成了协议。
在人质的威胁下，可汗·努尼恩·辛格迅速适应这个时代，迅速的学习新世界的科技、规则，来为31区设计武器和战舰，来帮助亚历山大·马库斯实现联邦星际舰队军事化的愿望。
而亚历山大·马库斯则答应在事成之后。
释放所有的基因改造人，还可汗等人自由。
但亚历山大·马库斯从一开始就没想着放可汗等人活路，而曾经身为一个统治者的可汗也清楚的知晓亚历山大·马库斯的心思，但族人之命握与他人之手的他无可奈何，只能在暗地里筹备计划。
可汗制作了一批先进的光子鱼雷，并将自己的七十二个族人装入其中，准备携带自己的族人逃出生天。
但是，可汗的暗中行动被亚历山大·马库斯发现了，无奈之下他只能逃亡。
可汗虽然逃了出来，但他觉得自己的七十二个族人肯定被亚历山大·马库斯全部杀掉。
于是开始了一条复仇之路。
作为一个精锐战士，可汗为此制订了详细而缜密的计划，并将其付诸实施。
首先，可汗要将位于伦敦。
表面上是星际舰队的档案馆，实则为31区分部的机构毁掉。
为此，可汗找到了一个在31区工作的星际舰队文职军官。
这位军官有着一个身患重症，即便以星际时代的医学也无